南京中医药大学中医药文献研究院本草文献研究室是在1958年成立的《中药大辞典》编写组基础上发展而来。自成立以来，在吴贻谷、宋立人等著名本草学专家的引领下，研究室始终秉持“条条追根,字字落实”的学术信条，构建了具有鲜明特色的本草文献研究体系。

研究室先后编纂完成的《中药大辞典》《中华本草》等标志性成果，奠定了本领域研究的学术地位，培养出一批专业人才，形成了文献考据-理论阐释-现代转化三位一体的研究范式。近年来陆续出版《中药大辞典》（第二版）《毒性本草类纂》《江苏中药志》以及部分《中医古籍整理丛书》等著作、主编《本草学概论》《本草典籍选读》等多部教材。

当前研究室聚焦三大研究方向：在古籍整理领域，系统开展珍稀本草典籍的校注考释与数字化研究；在药学史理论层面，致力于构建本草学术史研究体系，探索传统知识的现代诠释路径；在民族医药方向，深入开展多民族传统药物资源的比较研究与开发应用。近年来更积极推动学科交叉融合，运用人工智能、数据挖掘、生物信息学、药理学等新技术，持续引领传统文献研究的现代化转型。