方剂文献研究室在老一辈文献学家的带领下，取得许多令人瞩目的重大成果，完成多项国家级科研课题，其中《中医方剂大辞典》收录古今方剂96592首，填补了自明代以后方剂文献全面整理研究的空白。

目前研究室的研究方向：中医方剂文献信息资源的挖掘与临床应用研究。主要研究内容：方剂文献资源的整理与挖掘研究、方剂的配伍规律研究、方剂信息平台的建立、方剂的临床应用与开发研究。