在吴贻谷研究员、宋立人研究员等老一辈本草学专家的带领下，本草文献研究室完成了以《中药大辞典》、《中华本草》为代表的标志性成果，培养了一批优秀的本草文献研究人才，形成了独特研究思路和方法，在本草文献研究领域处于全国领先地位。目前该室的主要研究内容有：本草文献的整理与挖掘研究、本草学术研究以及民族药物研究。